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草莓轻型黄边病毒外壳蛋白抗原表位预测

草莓轻型黄边病毒外壳蛋白抗原表位预测

作     者:邓子兵 马建忠 王永刚 杨菊梅 魏艳 潘博 李印武 

作者机构:兰州理工大学生命科学与工程学院甘肃兰州730050 甘肃启明星节能科技有限公司甘肃兰州730913 

基  金:甘肃省科技计划项目(1504WKCA020) 甘肃启明星节能科技有限公司 国家大学生创新创业训练项目(DC2015085) 

出 版 物:《华北农学报》 (Acta Agriculturae Boreali-Sinica)

年 卷 期:2016年第31卷第S1期

页      码:106-111页

摘      要:抗原表位是抗体识别并结合抗原的部位。抗原表位的预测有助于重组抗原的设计、快速筛选和高活性抗原的快速制备。通过DNAStar、Ex PASy、TMHMM Sever2.0和IEDB等软件对草莓轻型黄边病毒的外壳蛋白的二级结构、理化及生物学性质进行了分析。分析结果显示,草莓轻型黄边病毒的外壳蛋白中不存在跨膜区域;平均亲水性为-0.252,属于可溶性蛋白;潜在的抗原表位有5个,平均抗原指数为0.026 5~0.077 3。预测的上述5个抗原表位是否有抗原活性及其活性强弱仍有待于相应的试验论证。

主 题 词:草莓轻型黄边病毒 外壳蛋白 抗原表位 结构预测 

学科分类:09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 090402[090402] 

核心收录:

馆 藏 号:203254065...

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