基于空间效应与竞争效应的林木遗传分析模型

作     者：林元震 张卫华 程玲 张心菲 张鑫鑫 LIN Yuanzhen;ZHANG Weihua;CHENG Ling;ZHANG Xinfei;ZHANG Xinxin

作者机构：华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广东广州510642 广东省林业科学研究院广东广州510520 

基　　金：国家自然科学基金(31470673) 

出 版 物：《华南农业大学学报》 (Journal of South China Agricultural University)

年 卷 期：2017年第38卷第5期

页      码：74-80页

摘      要：【目的】建立空间效应与竞争效应的分析模型,以提高林木遗传评估的准确性.【方法】利用R软件及其程序包breed R模拟数据,结合实测数据,采用XFA1结构拟合加性效应、近邻竞争效应和AR1结构拟合空间效应,建立随机区组设计模型(RCBM)、空间模型(SM)、空间与测量误差模型(SUM)和空间与竞争模型(SCM),运行ASReml估算遗传参数,进行模型比较。【结果】对于模拟数据,估计的参数结果均显示SCM是最优模型,其大大降低了随机误差方差,随机误差方差分别由7.56(RCBM)、5.72(SUM)降低到3.13(SCM),分别降低了58.6%、45.3%,并估算到四周近邻竞争方差;SCM模型估算的单株狭义遗传力在0.40左右,高于RCBM(0.24)和SUM模型(0.30);设置参数的不同初始值,SCM估计的参数结果均较为稳定;对于实测数据,估算结果与模拟结果比较一致。【结论】SCM模型是新的单株混合模型,可用于林木遗传分析。

主 题 词：空间效应 竞争效应 单株混合模型 REML 遗传分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 090701[090701] 0907[农学-草药学] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 

核心收录：

D　O　I：10.7671/j.issn.1001-411X.2017.05.013

馆 藏 号：203254118...