霍山石斛cpDNA全序列微卫星分布及分子鉴别研究

作     者：刘枫 赵群 戴军 姚厚军 陈存武 陈乃富 韩邦兴 LIU Feng;ZHAO Qun;DAI Jun;YAO Hou-jun;CHEN Cun-wu;CHEN Nai-fu;HAN Bang-xing

作者机构：安徽中医药大学安徽合肥230012 皖西学院安徽六安237012 安徽省石斛产业化开发协同创新中心安徽六安237012 

基　　金：国家林业行业标准制修订项目(2015-LY-152) 国家农业标准化示范区项目(SEQ8-109) 安徽省地方标准制修订项目(162) 

出 版 物：《中药材》 (Journal of Chinese Medicinal Materials)

年 卷 期：2016年第39卷第12期

页      码：2720-2724页

摘      要：目的:探讨霍山石斛的叶绿体基因组(chloroplast genomic DNA,cpDNA)中微卫星分布规律并设计引物鉴别霍山石斛及其伪品。方法:利用GenBank上已公布的霍山石斛cpDNA全序列,应用分子生物学软件对霍山石斛cpDNA中的微卫星位点统计分析,并设计筛选特异性引物对霍山石斛进行鉴别。结果:霍山石斛cpDNA中微卫星位点共有52个,以单碱基重复序列为主,共有25个,占总位点48%,其次二碱基重复序列有16个,占总位点30.8%,三碱基及三碱基以上重复序列在cpDNA中分布极少。在通过微卫星位点所设计的4对引物中,有2对引物可对霍山石斛及部分混伪品进行有效的鉴别。结论:所设计的引物可以对霍山石斛及其伪混品进行鉴别,且所得数据为霍山石斛的种群遗传和起源分化的研究提供了支持。

主 题 词：霍山石斛 叶绿体基因组 微卫星 引物设计 分子鉴定 

学科分类：1008[医学-中药学类] 1006[医学-中西医结合类] 100602[100602] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.13863/j.issn1001-4454.2016.12.011

馆 藏 号：203254201...