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基于紫娟茶叶片转录组的SSR引物开发

基于紫娟茶叶片转录组的SSR引物开发

作     者:周萌 宋维希 鄢文光 李晓霞 陈继伟 夏丽飞 梁家斌 陈林波 

作者机构:云南省农业科学院茶叶研究所云南勐海666201 云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心云南勐海666201 

基  金:云南科技厅重大专项(2013BB006) 国家自然科学基金项目(31460216 31560200) 云南省农业科学院专项基金项目(YAAS2014JC012) 云南省人才培养计划项目(2015HB105) 

出 版 物:《华北农学报》 (Acta Agriculturae Boreali-Sinica)

年 卷 期:2016年第31卷第S1期

页      码:140-145页

摘      要:以稀有茶树品种紫娟茶为研究对象,进行SSR引物开发的研究,从紫娟茶叶片转录组中筛选重复基元最多的SSR,设计并筛选紫娟茶的SSR引物。通过从已测序的紫娟茶叶片转录组中设计SSR引物共87对,通过对紫娟茶以及随机采摘的3份不同品种茶树提取DNA后进行PCR扩增,1%琼脂糖凝胶电泳分析,在紫外凝胶成像仪中观察拍照,判断是否扩增出目标条带。通过试验筛选出可以扩增出清晰目标条带的引物63对,有效率达72.4%,其中有33对表现出多态性,占有效SSR引物的52.4%。结果表明,从紫娟茶叶片转录组中设计引物是可行的。下一步研究将从这63对引物中开发紫娟茶的特异引物。

主 题 词:紫娟茶 SSR 引物开发 

学科分类:09[农学] 090203[090203] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 

核心收录:

馆 藏 号:203254296...

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