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青海BYDV-GAV青稞分离物基因组克隆及结构特征分析

青海BYDV-GAV青稞分离物基因组克隆及结构特征分析

作     者:李廷芳 吴淑华 季英华 赵文浩 周益军 郭青云 LI Tingfang WU Shuhua JI Yinghua ZHAO Wenhao ZHOU Yijun GUO Qingyun

作者机构:青海大学农牧学院青海西宁810016 江苏省农业科学院植物保护研究所/江苏省食品质量安全重点实验室-省部共建国家重点实验室培养基地江苏南京210014 青海省农林科学院/农业部西宁作物有害生物科学观测实验站/青海省农业有害生物综合治理重点实验室青海西宁810016 

基  金:国家自然科学基金项目(31572074) 江苏省"333"高层次人才培养工程科研项目(BRA2013262) 江苏省科技基础设施建设计划项目(4911406) 公益性行业(农业)科研专项经费项目(201303021) 

出 版 物:《麦类作物学报》 (Journal of Triticeae Crops)

年 卷 期:2017年第37卷第7期

页      码:900-906页

摘      要:大麦黄矮病毒(Barley yellow dwarf viruses,BYDVs)病是一种在世界范围内发生危害的禾谷类作物病毒病害。2014年笔者在对青海重要作物病毒病调查时发现田间青稞作物上有疑似BYDVs危害的症状,利用BYDVs引物对田间采集的9份典型症状病样进行了RT-PCR检测,结果均扩增到目的条带(约300bp),随机抽选样品进行序列测定,BLAST分析结果显示其与BYDV-GAV同源性最为接近(99.2%)。为进一步明确该分离物的分类地位及基因组结构特征,根据已测定的BYDV-GAV序列设计全长扩增引物,利用分段法克隆了其全基因组序列,发现其全长为5 683bp,具有典型的黄症病毒属的特征,编码6个ORF,有4个非编码区(UTR)。基因组序列聚类进化分析结果显示,其与BYDV-GAV聚类于同一分支,与中国陕西渭南小麦分离物亲缘关系较近。以上结果说明,该分离物是BYDV-GAV的一个分离物,这是青海BYDV-GAV青稞分离物全基因组的首次报道。

主 题 词:大麦黄矮病毒 青稞 BYDV-GAV 青海 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.7606/j.issn.1009-1041.2017.07.06

馆 藏 号:203254596...

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