青杄PwPSAF基因的克隆与组织表达分析

作     者：李长江 孙帆 张通 张凌云 Li Changjiang;Sun Fan;Zhang Tong;Zhang Lingyun

作者机构：北京林业大学林学院森林培育与保护教育部重点实验室北京100083 

基　　金：国家自然科学基金项目(31270663) 国家转基因生物新品种培育科技重大专项(2011ZX08009-003-002) 

出 版 物：《林业科学》 (Scientia Silvae Sinicae)

年 卷 期：2013年第49卷第10期

页      码：40-47页

摘      要：PSAF是绿色植物光系统Ⅰ反应中心F亚基,在光合作用电子迁移过程中起着重要作用。以青杄cDNA文库为模板,根据PwPSAF的EST序列设计引物,进行5 -RACE和3 -RACE试验,以获得青杄PwPSAF的末端序列,经过与EST序列进行拼接获取青杄PwPSAF的全长cDNA序列。基于其氨基酸序列,利用Expasy tools、DNAMAN、ClustalX和MEGA等工具,进行理化性质、二级结构和三级结构的生物信息学分析。结果表明:PwPSAF是一个由253 aa组成的蛋白质,理论分子量为27.04 kDa,等电点为9.57,预测蛋白有2个跨膜区域,蛋白质的C端具有保守的结构。RT-qPCR试验显示PwPSAF主要在青杄的针叶中表达。在种子萌发过程中吸胀期(0～ 2天)表达量最高,在4天时表达量降低,随着子叶的不断长出,其表达量又逐渐增高。在干旱和盐胁迫下,针叶中的PwPSAF的表达量被大幅下调。研究结果显示PwPSAF在青杄种子萌发及非生物逆境胁迫下的光合过程中起着重要作用。

主 题 词：青杄 PSAF 生物信息学分析 组织表达 胁迫响应 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 090701[090701] 0907[农学-草药学] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 

核心收录：

D　O　I：10.11707/j.1001-7488.20131007

馆 藏 号：203258068...