2.1c亚群猪瘟病毒GXF29/2013株全基因组克隆测序及遗传进化分析

作     者：黄耀华 邵卫星 杨雨辉 董雅琴 刘爽 吴发兴 张志 李晓成 HUANG Yao-hua;SHAO Wei-xing;YANG Yu-hui;DONG Ya-qin;LIU Shuang;WU Fa-xing;ZHANG Zhi;LI Xiao-cheng

作者机构：海南大学海南海口570228 中国动物卫生与流行病学中心山东青岛266000 

基　　金：2013年农业财政专项(1251413300007) 科技基础性专项(2012FY111000) 

出 版 物：《动物医学进展》 (Progress In Veterinary Medicine)

年 卷 期：2015年第36卷第8期

页      码：1-7页

摘      要：参考GenBank 登录的2.1 亚群猪瘟病毒（CSFV）的核苷酸序列,设计并合成4 对引物,应用RTPCR 技术,扩增出了CSFV 广西流行毒株GXF29/2013的全基因组,并进行核苷酸测序.结果GXF29/2013株的全基因组长度为12296个核苷酸.用MEGA5.0软件对GXF29/2013与GenBank上登录的20株不同亚型（1.1、2.1、2.2、2.3和3.4）CSFV 参考株进行全基因组核苷酸序列及开放阅读框编码的氨基酸序列比较,发现GXF29/2013 与参考株核苷酸序列同源性在83.2% ～98.0% 之间,氨基酸序列同源性在91.2%～98.8%之间.用E2基因进行系统发生树分析,结果表明GXF29/2013属于最近出现的2.1c亚群.对E2蛋白进行分析,结果表明GXF29/2013株有2.1c亚群毒株的特征,与2.1b毒株的遗传进化关系比与1.1亚群毒株的近.该毒株既保留了CSFV E2蛋白的一些关键特征,又与疫苗毒株的一些关键抗原位点不同.GXF29/2013病毒株全基因序列的获得为下一步进行CSFV 反向遗传操作平台的建立奠定了基础.

主 题 词：猪瘟病毒 全基因组 序列分析 2.1c亚群 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 090601[090601] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 0906[农学-水产类] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.16437/j.cnki.1007-5038.2015.08.001

馆 藏 号：203263338...