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动物组蛋白H3K4三甲基化转移酶MLL3的生物信息学分析(英文)

动物组蛋白H3K4三甲基化转移酶MLL3的生物信息学分析(英文)

作     者:尚明保 杨旬旬 吴风瑞 丁彪 刘勇 李文雍 

作者机构:安徽农业大学生命科学学院安徽合肥230036 胚胎发育与生殖调节安徽省重点实验室安徽阜阳236041 阜阳师范学院生命科学学院安徽阜阳236041 

基  金:Supported by National Natural Science Foundation of China (No.31071310) Provincial Scientific Research Institution Commissioned Special Project of Fuyang Normal University (No.2011PTFY03ZD) Natural Science Research Project for Universities from the Education Department of Anhui Province (KJ2011B121) Natural Science Foundation of Fuyang Normal University (No.2010FSKJ13)~~ 

出 版 物:《Agricultural Science & Technology》 (农业科学与技术(英文版))

年 卷 期:2012年第13卷第3期

页      码:512-516,550页

摘      要:[目的]对动物组蛋白H3K4三甲基化转移酶MLL3进行生物信息学分析,从而探寻其相对保守的进化过程以揭示组蛋白H3K4三甲基化转移酶MLL3在在人类癌症的中的作用。[方法]利用生物信息学的方法,对小鼠MLL3的基因结构、氨基酸序列、系统进化树、染色体定位和共线性等问题进行分析。[结果]编码合成的小鼠MLL3蛋白质一级结构包括7个锌指结构域、1个HMG-box(高迁移率族蛋白)、1个FYRN(N-末端富含苯丙氨酸或酪氨酸区域)、1个FYRC(C-末端富含苯丙氨酸或酪氨酸区域)、1个SET域和1个postSET域;从序列对比和同源性上发现,该研究中的19种动物都基本上具有这些结构,说明这些结构在进化上是相对保守的,其中SET域具有高度的保守性,是维持组蛋白甲基化酶活性所必须的;从系统发生上看,19种动物在进化树上的位置与其分类地位相一致;在共线性分析中,虽然小鼠和人的MLL3基因位于不同的染色体上,但其上游和下游具有相同的基因,说明小鼠和人的MLL3基因具有共线性。[结论]不仅揭示了MLL3的核苷酸序列及其氨基酸序列的一级结构,为以后研究其高级结构和蛋白质的功能奠定了基础;同时也为后期进行小鼠MLL3基因的引物设计、启动子分析、基因的克隆、定位和表达的调控模式研究奠定了基础。

主 题 词:组蛋白甲基化酶 MLL3 SET结构域 生物信息学 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D O I:10.3969/j.issn.1009-4229-B.2012.03.008

馆 藏 号:203263806...

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