基于功能域组分的蛋白质折叠类型识别

作     者：闫金丽 陈治伟 徐海松 李晓琴 YAN Jin-Li,CHEN Zhi-Wei,XU Hai-Song,LI Xiao-Qin**(Bioengineering Center,Beijing University of Technology,Beijing 100124,China)

作者机构：北京工业大学生命科学与生物工程学院北京100124 

基　　金：国家自然科学基金(30570427) 北京市自然科学基金(4092008)资助项目~~ 

出 版 物：《生物化学与生物物理进展》 (Progress In Biochemistry and Biophysics)

年 卷 期：2011年第38卷第2期

页      码：166-172页

摘      要：蛋白质空间结构研究是分子生物学、细胞生物学、生物化学以及药物设计等领域的重要课题.折叠类型反映了蛋白质核心结构的拓扑模式,对折叠类型的识别是蛋白质序列与结构关系研究的重要内容.选取LIFCA数据库中样本量较大的53种折叠类型,应用功能域组分方法进行折叠识别.将Astral 1.65中序列一致性小于95%的样本作为检验集,全库检验结果中平均敏感性为96.42%,特异性为99.91%,马修相关系数(MCC)为0.91,各项统计结果表明:功能域组分方法可以很好地应用在蛋白质折叠识别中,LIFCA相对简单的分类规则可以很好地集中蛋白质的大部分功能特性,反映了结构与功能的对应关系.

主 题 词：折叠类型 折叠识别 功能域 LIFCA数据库 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 0831[工学-公安技术类] 071011[071011] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 0703[理学-化学类] 

核心收录：

D　O　I：10.3724/SP.J.1206.2010.00345

馆 藏 号：203264796...