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犬贾第虫病毒(长春株)全基因组序列分析

犬贾第虫病毒(长春株)全基因组序列分析

作     者:陈丽凤 李建华 张西臣 刘全 赵月萍 曹利利 陈超 CHEN Li-feng;LI Jian-hua;ZHANG Xi-chen;LIU Quan;ZHAO Yue-ping;CAO Li-li;CHEN Chao

作者机构:吉林大学畜牧兽医学院长春130062 军事医学科学院军事兽医研究所长春130062 

基  金:国家自然科学基金(30300260) 

出 版 物:《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期:2006年第37卷第4期

页      码:408-411页

摘      要:根据已报道的人源蓝氏贾第虫病毒序列设计了互相重叠的6对特异性引物,以犬贾第虫(长春株)纯培养滋养体总核酸为模板进行RT-PCR。PCR产物连接到pMD18-T载体进行测序,通过BLAST在GenBank进行同源性搜索,并用DNAMAN分子生物学软件进行分析。结果测得我国犬贾第虫病毒(长春株)基因组全长为6 276bp(DQ238861),编码1个有887个氨基酸残基的衣壳蛋白和1 056个氨基酸残基的融合蛋白,这2个阅读框被-1核糖体移码框分开,重叠处有220 nt。基因组中G+C占49.62%。其序列与国外报道的人源蓝氏贾第虫病毒(L13218)序列同源性为94.62%,编码的氨基酸同源性为93.50%;与国内人源蓝氏贾第虫病毒(AF525216)序列同源性为98.88%,编码的氨基酸同源性为98.30%。

主 题 词:犬贾第虫病毒 全长cDNA序列 基因组 序列分析 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 1007[医学-药学类] 100705[100705] 07[理学] 071005[071005] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:0366-6964.2006.04.019

馆 藏 号:203265345...

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