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AcSDKP与TGF-β受体1相互作用的分子对接研究

AcSDKP与TGF-β受体1相互作用的分子对接研究

作     者:梁礼 邱卫民 徐嘉浩 杨雯 陈晗 高剑 LIANG Li;QIU Weimin;XU Jiahao;YANG Wen;CHEN Han;GAO Jian

作者机构:徐州医科大学江苏省新药研究与临床药学重点实验室江苏徐州221004 

基  金:江苏省自然科学基金青年项目(BK20140225) 徐州市科技项目(KC16SG249) 徐州医科大学优秀人才科研启动基金(D2014008) 江苏省大学生创新创业训练计划项目(201610313014Z) 国家级大学生创新创业训练计划项目(201610313014) 江苏高校品牌专业建设工程资助项目(PPZY2015C224) 

出 版 物:《徐州医科大学学报》 (Journal of Xuzhou Medical University)

年 卷 期:2017年第37卷第8期

页      码:495-497页

摘      要:目的利用分子对接方法阐释AcSDKP及其突变体多肽与转化生长因子B(TGF-β)受体1相互作用。方法利用药物设计平台Sybyl-X2.1构建的AcSDKP及其突变体多肽的分子结构,采用Surflex分子对接方法将AcSDKP及其突变体多肽对接到TGF-β受体1中,考察它们的分子对接打分数值及相应的结合用模式。结果AcSDKP可与TGF-β受体1形成稳定的相互作用,且以氢键相互作用为主。AcSDKP的第2位氨基酸当突变为色氨酸时(即AcSWKP)具有比原型肽AcSDKP更强的TGF-β受体1结合能力。除了AcSWKP,其他突变体在与TGF-β受体1的相互作用时要弱于AcSDKP。结论AcSDKP可以与TGF-β受体1形成稳定的相互作用,说明AcSDKP可能是通过抑制TGF-β受体1来发挥其抗纤维化的生物活性。另外,分子对接方法预测AcS-DKP的突变多肽AcSWKP可能具有更强的抗纤维化活性。

主 题 词:AcSDKP TGF-β受体1 分子对接 结合模式 

学科分类:1007[医学-药学类] 100701[100701] 10[医学] 

D O I:10.3969/j.issn.1000-2065.2017.08.002

馆 藏 号:203267616...

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