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反向PCR法克隆芳香烃龙胆酸降解途径中诱导型龙胆酸1,2-加双氧酶基因

反向PCR法克隆芳香烃龙胆酸降解途径中诱导型龙胆酸1,2-加双氧酶基因

作     者:赵渝 郭鲁申 徐亚同 陆贻通 高林 ZHAO Yu;GUO Lusheng;XU Yatong;LU Yitong;GAO Lin

作者机构:华东师范大学资源与环境科学学院 上海师范大学生命与环境科学学院上海200234 上海师范大学生命与环境科学学院 上海交通大学资源与环境系 

基  金:国家自然科学基金资助项目(No.20337010) 国家基础研究重大项目(2004CB418503) 上海市基础研究重点项目(04JC14051) 上海市生态学重点学科建设资助 

出 版 物:《应用与环境生物学报》 (Chinese Journal of Applied and Environmental Biology)

年 卷 期:2007年第13卷第1期

页      码:87-92页

摘      要:龙胆酸1,2-加双氧酶(GDO)是芳香烃龙胆酸途径的一个关键酶.产碱假单胞菌P25X具有保守性与诱导性各一组GDO同工酶,突变株SNZ28的保守型龙胆酸1,2加双氧酶基因(GDOⅠ)被链霉素/奇霉素抗性基因打断,但在含有龙胆酸盐的基本培养基上,仍能明显观察到GDO的活性.由龙胆酸诱导生长的SNZ28全蛋白二维电泳结果分析,获得了一个与Ralstoniasp.U2的GDO酶有极高同源性的蛋白点.根据对该蛋白点的N端和Q-Tof测序的结果,设计了一对简并引物,克隆了诱导型GDO酶的片段,通过对此片段的分析,设计了逆向PCR引物,利用Southern blot杂交,确定了合适的限制性内切酶(SalⅠ和SphⅠ),以单一酶切的P25X基因组DNA自联后的产物为模板,进行反向PCR.测序表明,获得了一段1047bp与Ralstoniasp.U2.的龙胆酸1,2-加双氧酶具有极高同源性的序列.研究结果揭示了SNZ28中存在诱导型GDO酶.本文中也对不同来源的GDO酶进行了比较研究,其结果为进一步对生物降解基因的进化研究打下了基础.

主 题 词:芳香烃 龙胆酸 诱导酶 反向PCR法 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:1006-687X.2007.01.020

馆 藏 号:203270652...

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