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犬瘟热疫苗株CDV_3核蛋白基因全序列测序及分析

犬瘟热疫苗株CDV_3核蛋白基因全序列测序及分析

作     者:王凤雪 闫喜军 柴秀丽 张海玲 邵西群 罗国良 赵建军 WANG Feng-Xue;YAN Xi-Jun;CHAI Xiu-Li;ZHANG Hai-ling;SHAO Xi-Qun;LUO Guo-liang;ZHAO Jian-jun

作者机构:中国农业科学院特产研究所吉林吉林132109 

基  金:科技部科研院所社会公益研究专项(2005DIB4J048) 

出 版 物:《特产研究》 (Special Wild Economic Animal and Plant Research)

年 卷 期:2007年第29卷第4期

页      码:7-10页

摘      要:根据GenBank上发表的犬瘟热病毒(CDV)核蛋白(N)蛋白基因序列,设计合成了1对寡聚核苷酸引物,提取犬瘟热病毒疫苗株CDV3的RNA为模板,采用RT-PCR扩增病毒的N蛋白基因,并进行产物克隆和序列分析。将CDV3疫苗株N基因与GenBank数据库中的疫苗株Onderstepoort及中国、美国和德国等分离的疫苗株或毒株共14株CDV N基因序列进行同源性分析,发现CDV3 N基因序列与疫苗株Onderstepoort的同源性为97.1%,与其他分离毒株的核苷酸同源性为92.8%~94.0%,其中与中国分离的TN株同源性为93.6%;然而,CDV3 N蛋白与它们的氨基酸同源性却基本都为96.6%~97.3%。这说明虽然犬瘟热弱毒株CDV3在核苷酸水平上与其他疫苗株毒株的差异较大,但是在氨基酸水平上的比较差异较小。

主 题 词:犬瘟热病毒 N基因 序列分析 同源性 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D O I:10.3969/j.issn.1001-4721.2007.04.003

馆 藏 号:203270882...

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