水牛FADS2基因的电子克隆及序列分析

作     者：马小娅 庞春英 梁莎莎 陆杏蓉 朱鹏 段安琴 梁贤威 邓廷贤 MA Xiao-ya;PANG Chun-ying;LIANG Sha-sha;LU Xing-rong;ZHU Peng;DUAN An-qin;LIANG Xian-wei;DENG Ting-xian

作者机构：中国农业科学院广西水牛研究所、农业部(广西)水牛遗传繁育重点实验室南宁530001 

基　　金：广西科技重大专项(桂科AA16450002) 广西科技公关国合项目(桂科合1504001-3) 广西自然科学基金青年项目(2015GXNSFBA139103) 广西水产畜牧科技推广应用项目(桂渔牧科201633009) 

出 版 物：《中国畜牧兽医》 (China Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期：2017年第44卷第10期

页      码：2829-2836页

摘      要：试验旨在利用电子克隆法对水牛Δ6脂肪酸脱氢酶(Δ6-fatty acid desaturases,FADS2)基因进行克隆和生物信息学分析,为探究FADS2基因对水牛泌乳性能的作用机制奠定基础。以奶牛FADS2基因序列(Gen Bank登录号:NM_001083444.1)为探针设计引物,利用电子克隆法克隆水牛FADS2基因,并通过RT-PCR验证,对FADS2基因的序列特征进行生物信息学分析。测序结果表明,水牛FADS2基因序列全长为36 600 bp,由12个外显子和11个内含子组成,包含一个长1 335 bp的开放阅读框,可编码444个氨基酸。序列同源性分析显示,水牛FADS2基因编码序列与牦牛、黄牛、人、猪、家兔、虎鲸和褐家鼠序列的同源性分别为98.88%、98.88%、89.66%、90.79%、90.85%、92.35%和87.11%。蛋白质预测分析表明,水牛FADS2蛋白分子质量为52.51 ku,理论等电点(p I)为8.75,呈弱碱性,属于亲水性蛋白,无信号肽。系统进化树分析结果表明,FADS2基因在不同物种及进化的过程中具有高度保守性,其中水牛与牦牛、黄牛亲缘关系较近,与褐家鼠亲缘关系较远。水牛FADS2基因的成功克隆为今后阐明水牛泌乳性能的作用机制奠定了基础。

主 题 词：水牛 FADS2基因 电子克隆 生物信息学分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.16431/j.cnki.1671-7236.2017.10.001

馆 藏 号：203273890...