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改进的四引物扩增受阻突变体系PCR方法同时检测叶酸代谢过程相关的四个单核苷酸多态性位点的研究

改进的四引物扩增受阻突变体系PCR方法同时检测叶酸代谢过程相关的四个单核苷酸多态性位点的研究

作     者:段素霞 李贵霞 赵梦川 王乐 冯志山 张益 马学军 Duan Suxia;Li Guixia;Zhao Mengchuan;Wang Le;Feng Zhishan;Zhang Yi;Ma Xuejun

作者机构:河北医科大学研究生学院石家庄050031 河北省儿童医院检验科 河北省儿童医院儿科研究所 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 

基  金:河北省政府资助省级临床医学优秀人才项目 国家重点研发计划(2016YFC1200900) 

出 版 物:《中华检验医学杂志》 (Chinese Journal of Laboratory Medicine)

年 卷 期:2017年第40卷第10期

页      码:799-804页

摘      要:目的建立改进的四引物扩增受阻突变体系PCR(T-ARMS-PCR)检测方法,实现单管一次性检测叶酸代谢过程相关的4个单核苷酸多态性(SNP)位点:rs1801133,rs1801131,rs1805087和rs1801394。方法方法学建立。于2017年1至4月在河北省儿童医院检验科收集150名体检儿童抗凝全血标本以待验证。利用T-ARMS-PCR原理及多重嵌合引物策略设计rs1801133、rs1801131、rs1805087及rs1801394的特异性内外嵌合引物。通过优化引物浓度和反应条件,经单管PCR反应,结合QIAxcel毛细管电泳分析扩增产物长度,判读150份标本的SNP基因型,同时所有标本经测序法进一步验证。利用SPSS 17.0统计软件卡方检验对150份标本的4个SNP位点分别进行哈迪-温伯格遗传平衡(HWE)检测。结果改进的T-ARMS-PCR结合毛细管电泳分析的方法可在3 h内一次性识别本研究中叶酸代谢过程相关的4个SNP位点的8个不同等位基因,可对150份全血标本的SNP位点准确分型,其分型结果与测序法完全相符。4个SNP位点基因型的分布均符合HWE平衡定律(χ^2rs1801133=0.69, Prs1801133=0.40; χ^2rs1801131=0.21, Prs1801131=0.64; χ^2rs1805087=3.32, Prs1805087=0.07; χ^2rs1801394=1.91, Prs1801394=0.17)。结论本研究建立的改进的T-ARMS-PCR结合毛细管电泳分析方法,可准确地同时检测叶酸代谢过程相关的4个SNP位点,为指导人群特异性地补充叶酸提供了一种可能的技术手段。

主 题 词:叶酸 代谢 多态性,单核苷酸 聚合酶链反应 电泳,毛细管 DNA突变分析 DNA引物 

学科分类:100208[100208] 1002[医学-临床医学类] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2017.10.013

馆 藏 号:203279440...

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