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蛋白质-RNA对接中打分函数设计及RNA结合位点识别研究进展

蛋白质-RNA对接中打分函数设计及RNA结合位点识别研究进展

作     者:李春华 刘洋 陆林 马梦琳 谭建军 张小轶 王存新 LI Chunhua;LIU Yang;LU Lin;MA Menglin;TAN Jianjun;ZHANG Xiaoyi;WANG Cunxin

作者机构:北京工业大学生命科学与生物工程学院北京100124 

基  金:国家自然科学基金资助项目(11474013) 北京市自然科学基金资助项目(4152011) 

出 版 物:《北京工业大学学报》 (Journal of Beijing University of Technology)

年 卷 期:2017年第43卷第12期

页      码:1779-1786页

摘      要:分子对接是目前研究蛋白质-RNA相互作用与识别的有效方法之一.其中,打分函数的合理设计与分子结合位点的准确识别对成功预测蛋白质-RNA复合物结构至关重要.结合小组的工作,对用分子对接方法预测蛋白质-RNA复合物结构中所涉及2个关键性问题(即分子对接打分函数的设计和RNA结合位点的预测)及研究进展进行了回顾,并对几种常用的方法进行了比较.最后分析了这两方面研究目前所存在的主要问题,并对未来的发展方向进行了展望.

主 题 词:蛋白质-RNA相互作用 分子对接 打分函数 RNA结合位点预测 

学科分类:071011[071011] 0710[理学-生物科学类] 07[理学] 

D O I:10.11936/bjutxb2017050025

馆 藏 号:203279621...

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