长链非编码RNA 1010001 N08 Rik在支气管肺发育不良形成中的表达规律及生物信息学分析
作者机构：南京医科大学附属淮安第一医院新生儿科淮安市小儿呼吸诊疗重点实验室223300
基 金：江苏省临床医学专项(B12014063) 淮安市科技攻关项目(HAS2014010) 淮安市创新能力建设计划(HAP201607)
出 版 物：《中华新生儿科杂志（中英文）》 (Chinese Journal of Neonatology)
年 卷 期：2017年第32卷第5期
页 码：384-388页
摘 要：目的 初步研究长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA） 1010001N08Rik在高氧诱导新生小鼠支气管肺发育不良（bronchopulmonarydysplasia,BPD）形成过程中的表达规律,并对其进行系统的生物信息学分析,预测其参与BPD发生发展的可能作用机制.方法 通过UCSC在线基因浏览工具获取1010001N08 Rik序列、所在基因组位置及其邻近基因相关信息;应用Ensemble数据库预测1010001N08Rik的靶基因.将新生C57BL/6J小鼠置于95％高氧环境下7d,制备高氧诱导新生小鼠BPD模型.采用逆转录聚合酶链反应检测1010001N08Rik、Gata 6 mRNA在BPD形成过程（第0、1、3、5、7天）中的变化情况,并通过t检验比较其表达差异.结果 1010001N08Rik在BPD形成过程第1、3、5、7天相对表达量分别为1.21±0.33、2.02±0.41、2.95±0.45、4.20±0.48,其表达逐渐增加,且第1、3、5、7天各组相近两个时点间差异均有统计学意义（P＜ 0.05）;Gata 6 mRNA第1、3、5、7天相对表达量分别为0.92±0.30、1.10±0.31、0.86±0.24、0.45±0.08,第7天低于第5天（P＜0.05）,其余相近两个时间点比较差异无统计学意义（P＞0.05）.1010001N08Rik在哺乳动物间具有较高的保守性,其所在染色体区域存在大量转录因子结合位点及表观遗传学线索,Gata 6为其可能的调控靶标.结论 1010001N08Rik在BPD形成过程中表达量逐渐增加,生物信息学分析及初步实验提示其可能通过下调Gata 6表达参与BPD形成过程.
主 题 词：支气管肺发育不良 RNA 分子生物学 小鼠 1010001N08Rik
学科分类：1002[医学-临床医学类] 100202[100202] 10[医学]
D O I：10.3760/cma.j.issn.2096-2932.2017.05.015
馆 藏 号：203280175...
