猪圆环病毒2型2d基因型毒株的全基因组序列分析

作     者：吴异健 陈强 叶财旺 蔡栋灵 张英扬 骆钰 刘立荣 李鸿文 朱二鹏 吴宝成 WU Yi-jian;CHEN Qiang;YU Cai-wang;CAI Dong-ling;ZHANG Ying-yang;LUO Yu;LIU Li-rong;LI Hong-wen;ZHU Er-peng;WU Bao-cheng

作者机构：福建农林大学动物科学学院福建福州350002 福建省兽医中药与动物保健重点实验室福建福州350002 

基　　金：国家自然科学基金青年基金项目(31502110):猴头菇多糖对氧化应激状态下猪小肠上皮通透性的调节及其机制 

出 版 物：《中国兽医科学》 (Chinese Veterinary Science)

年 卷 期：2017年第47卷第12期

页      码：1533-1538页

摘      要：根据Gen Bank中猪圆环病毒2型(PCV 2)基因序列,设计特异性引物,用PCR方法从福州郊区某猪场疑似PMWS仔猪病料处理后接种育传三代的PK-15细胞中扩增1个分离毒株的全基因组,并将其克隆到p MD-18T载体上,对鉴定为阳性的重组质粒送检测序。对该分离株的基因全序列及其开放阅读框2(ORF2)进行同源性分析及遗传进化关系分析。PCR鉴定结果显示,本试验中分离到的病毒属于PCV2,命名为PCV2-FZ株。全基因组序列分析显示,分离株全基因组大小为1 767 bp,含有11个开放性阅读框,其中ORF2大小为705 bp,共编码234个氨基酸。PCV2-FZ株与参考毒株基因全序列的核苷酸同源性为94.3%~99.4%,与SD毒株同源性最高,为99.4%;与DK1980PMWSfree和DK1990PMWSfree毒株同源性最低,为94.3%。分离株与参考毒株ORF2核苷酸同源性为89.2%~99.4%,其中与SD毒株同源性最高,为99.4%,与DK1980PMWSfree毒株和DK1987PMWSfree毒株同源性最低,均为89.2%。全基因组与ORF2序列遗传进化树分析均表明,PCV2-FZ株属于PCV2d基因型。本研究从福建省首次分离并鉴定了1株PCV2d型毒株,这对PCV2流行病学研究和遗传变异分析具有重要意义。

主 题 词：猪圆环病毒2型 分离 鉴定 全基因序列 PCV2d基因型 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D　O　I：10.16656/j.issn.1673-4696.2017.12.011

馆 藏 号：203280464...