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基于邻域粗糙集与鱼群智能的基因选择方法

基于邻域粗糙集与鱼群智能的基因选择方法

作     者:陈玉明 朱清新 曾志强 孙金华 唐朝辉 CHEN Yu-ming;ZHU Qing-xin;ZENG Zhi-qiang;SUN Jin-hua;TANG Chao-hui

作者机构:厦门理工学院计算机与信息工程学院福建厦门361024 电子科技大学计算机科学与工程学院成都611731 

基  金:国家自然科学基金(61573297) 福建省自然科学基金(2015J01277) 

出 版 物:《电子科技大学学报》 (Journal of University of Electronic Science and Technology of China)

年 卷 期:2018年第47卷第1期

页      码:99-104页

摘      要:针对高维、小样本及不确定性的基因表达数据,融合模糊可容忍性的邻域粒化技术与具有全局寻优能力的鱼群智能算法,提出基于邻域粗糙集与鱼群智能的基因选择方法。首先,采用邻域粗糙集对基因数据进行邻域粒化,形成邻域粒子;其次,提出基于邻域分类精度的不确定性评价函数,用以评价邻域粒子的不确定性,分辨关键性基因;进一步融合鱼群智能方法,设计一种基因选择算法,选取分类性强的少量关键基因;最后,在两个癌症基因数据集中进行基因选择,采用SVM分类器对获取的关键基因组进行分类实验。实验结果表明,采用该方法获取的基因组具有较低的冗余度及较好的分类性能。

主 题 词:鱼群算法 基因选择 粒计算 邻域粗糙集 粗糙集 

学科分类:12[管理学] 1201[管理学-管理科学与工程类] 0808[工学-自动化类] 0809[工学-计算机类] 081104[081104] 08[工学] 0835[0835] 0811[工学-水利类] 0812[工学-测绘类] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1001-0548.2018.01.015

馆 藏 号:203282178...

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