CAPS标记开发及果实相关性状QTL分析

作     者：迟莹莹 栾非时 李桂英 CHI Ying-ying;LUAN Fei-shi;LI Gui-ying

作者机构：东北农业大学哈尔滨150030 

出 版 物：《黑龙江科学》 (Heilongjiang Science)

年 卷 期：2018年第9卷第2期

页      码：1-8页

摘      要：利用西瓜基因组重测序数据挖掘SNP位点并将其转变为CAPS标记,构建遗传连锁图谱,对西瓜果实相关性状进行QTL分析。以普通西瓜品系(Citrullus lanatus ***)花园母本和黏籽西瓜品系(Citrullus lanatus ***)PI 186490为亲本,构建BC1群体。对亲本材料进行基因组重测序,覆盖西瓜基因组20×以上,发掘SNP位点,运用SNP2CAPS软件选择7种限制性内切酶对包含SNP位点的序列进行酶切位点分析并将其转化为CAPS标记。筛选具有多态性的CAPS标记,对225株BC1群体内各单株进行基因分型,对西瓜果实相关性状进行QTL分析。在两亲本间共获得SNP位点751 532个,设计CAPS引物450对,筛选出多态性引物200对,贡献率为44.44%。所构建遗传连锁图谱包含11个连锁群(分别对应西瓜基因组的11条染色体),覆盖基因组长度1 376.95 cm。获得与果实相关性状QTL位点15个。说明西瓜是可溶性固形物,具有果肉硬度、种子百粒重符合的数量性状遗传特点,种皮底色受四个QTL位点控制。

主 题 词：西瓜 遗传图谱 SNP CAPS QTL 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 090102[090102] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1674-8646.2018.02.001

馆 藏 号：203282219...