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葛根SCoT-PCR反应体系优化及引物筛选

葛根SCoT-PCR反应体系优化及引物筛选

作     者:尚小红 严华兵 曹升 张尚文 谢向誉 王艳 欧昆鹏 SHANG Xiao-hong;YAN Hua-bing;CAO Sheng;ZHANG Shang-wen;XIE Xiang-yu;WANG Yan;OU Kun-peng

作者机构:广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室南宁530007 广西农业科学院经济作物研究所南宁530007 广西农业科学院生物技术研究所南宁530007 

基  金:广西重点研发计划项目(桂科AB16380087) 广西藤县粉葛试验站项目(桂TS201431) 广西科技基地和人才专项项目(桂科AD17195072) 

出 版 物:《南方农业学报》 (Journal of Southern Agriculture)

年 卷 期:2018年第49卷第1期

页      码:1-7页

摘      要:【目的】优化葛根SCoT-PCR反应体系,筛选适用于葛根的SCoT引物,为利用SCoT分子标记进行葛根种质资源鉴定、遗传多样性分析及分子标记辅助育种提供技术支持。【方法】采用正交设计对SCoT-PCR反应体系中的DNA模板量、dNTPs浓度、Mg^(2+)浓度、Taq DNA聚合酶量和引物浓度5个因素进行优化,利用最佳SCoT-PCR反应体系筛选出适用于葛根的SCoT引物,并对该体系进行验证。【结果】最佳葛根SCoT-PCR反应体系20.00μL:DNA模板50.00 ng,dNTPs 0.25 mmol/L,Mg^(2+)1.50 mmol/L,引物0.80μmol/L,Taq DNA聚合酶0.50 U。利用该体系从36条SCoT引物中筛选出35条可从葛根中扩增出清晰条带的引物。使用3条引物对18个葛根材料进行PCR扩增,PCR产物表现出良好的重复性、稳定性和丰富的多态性。【结论】建立的最佳葛根SCoT-PCR反应体系和筛选获得的35条SCoT引物可适用于葛根种质资种鉴定、遗传多样性分析、相关分子标记开发等研究。

主 题 词:葛根 SCoT-PCR 反应体系优化 引物筛选 

学科分类:1008[医学-中药学类] 10[医学] 

D O I:10.3969/j.issn.2095-1191.2018.01.01

馆 藏 号:203282355...

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