红平红球菌复苏促进因子基因克隆及功能域分析

作     者：岳靓 陈吉祥 杨智 李彦林 芮文鸿 王永刚 Yue Liang;Chen Jixiang;Yang Zhi;Li Yanlin;Rui Wenhong;Wang Yonggang

作者机构：兰州理工大学石油化工学院兰州730050 兰州理工大学能源与动力学院兰州730050 

基　　金：国家自然科学基金(No:31272694)资助 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2018年第37卷第1期

页      码：286-295页

摘      要：复苏促进因子（Rpf）广泛存在于高G＋C含量的革兰氏阳性细菌中,与细菌生长及抵抗不良环境有关,不同细菌Rpf种类和数量有一定差异。红平红球菌（Rhodococcus erythropolis）KB1分离自石油污染土壤,具有高效石油降解能力和环境适应性。为探索Rpf在红平红球菌KB1适应环境过程中作用,设计了复苏因子基因特异引物,从红平红球菌KB1基因组DNA扩增出4种rpf基因。序列分析发现4种基因分别与藤黄微球菌（Micrococcus luteus）rpf基因,结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis）rpfB、rpfC及链霉菌（Streptomyces coelicolor）rpfB相似性较高。4个rpf基因编码蛋白都有一个类似Mt细胞复苏促进因子Rpf域,由大约70个氨基酸组成。其中Rpf-1与结核分枝杆菌、链霉菌RpfC相似,只含1个Rpf结构域;Rpf-2与结核分枝杆菌RpfB相似,含有1个Rpf域、1个G5域和2个DUF348;Rpf-3与链霉菌RpfB相似,含有1个Rpf域、G5域和3个DUF348;Rpf-4与藤黄微球菌Rpf相似,含1个Rpf域和1个LysM域。Rpf-2、Rpf-3含信号肽序列,Rpf-1、Rpf-4不含信号肽。

主 题 词：红平红球菌 复苏促进因子 基因 结构域 非可培养 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 071007[071007] 

核心收录：

D　O　I：10.13417/j.gab.037.000286

馆 藏 号：203282509...