版纳微型猪近交系BARD1基因克隆、mRNA表达及蛋白质功能生物信息学分析

作     者：张霞 王配 霍金龙 王淑燕 ZHANG Xia;WANG Pei;HUO Jinlong;WANG Shuyan

作者机构：云南农业大学云南省版纳微型猪近交系重点实验室昆明650201 云南农业大学动物科学技术学院昆明650201 

基　　金：国家自然科学基金项目(31460580 31660637 31660650) 

出 版 物：《吉林农业大学学报》 (Journal of Jilin Agricultural University)

年 卷 期：2018年第40卷第1期

页      码：103-109页

摘      要：BARD1基因在精子形成过程中起重要作用。以Gen Bank下载的牛、鼠BARD1基因序列以及猪EST序列克隆猪BARD1基因,设计特异引物克隆版纳微型猪近交系(BMI)BARD1基因。应用q PCR分析15个重要组织的mRNA表达谱,并对蛋白质序列进行功能生物信息学分析,构建多物种系统进化树。研究获得了BMI BARD1 2 334 bp的编码区序列(Gen Bank登录号KU705640,对应的氨基酸登录号AOC89058),编码777个氨基酸,蛋白质分子量(Mw)为86.15 ku,等电点(p I)为8.84。多组织荧光定量表达分析表明:BARD1基因在睾丸和尿道球腺中高表达,在肝脏、脾脏、肺、十二指肠、结肠中中度表达,在心脏、肾脏、胃脏、脑、肌肉、精囊腺、前列腺、附睾中低表达。功能生物信息学分析表明,BARD1蛋白质存在3个保守结构域,无跨膜结构,无信号肽序列;N末端疏水,C末端亲水;有6类功能活性位点,位于细胞核的概率是94.1%。系统进化分析表明,BMI与牛、羊的亲缘关系最近。

主 题 词：BRCA1相关联的指环蛋白1 版纳微型猪近交系 生物信息学 组织表达 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 0905[农学-林学类] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090501[090501] 090102[090102] 

D　O　I：10.13327/j.jjlau.2017.3291

馆 藏 号：203282783...