Tag Array基因芯片快速诊断抗结核药物耐药的可行性研究

作     者：武文杰 程鹏 张泽华 罗飞 许建中 Wu Wenjie;Cheng Peng;Zhang Zehua;Luo Fei;Xu Jianzhong

作者机构：陆军军医大学第一附属医院(西南医院)骨科400038 

基　　金：国家自然科学基金(81672193) 

出 版 物：《中华骨科杂志》 (Chinese Journal of Orthopaedics)

年 卷 期：2018年第38卷第2期

页      码：110-119页

摘      要：目的评价Tag Array结核耐药基因检测芯片检测骨关节结核临床分离株的敏感度和特异性。方法在北京疾控中心获取已进行测序的24株不同突变型的结核杆菌菌株并进行质粒提取。进行浓度检测，并将不同质粒分别稀释成1×10^2拷贝／μl、1×103拷贝／μl、1×10^4拷贝／μl、1×10^5拷贝／μl、5×10^6拷贝／μl、1×10^6拷贝／μl后进行多重PCR扩增及芯片杂交，分析该芯片检测样本的敏感度和特异性，评估其在临床实际检测中的可行性。从重庆市公共医疗卫生救治中心获取187株骨结核临床分离株样本，其中敏感菌50株，耐药菌137株。设计、优化和制备芯片检测体系，对187株结核分枝杆菌临床分离株进行药敏检测，对照测序结果和表型药敏结果分析芯片的灵敏度、特异性。结果在1×10^3拷贝／μl及以上组均显示出与测序结果一致的突变型，在1×10^2拷贝／μl组有29株出现了假阴性结果。126株利福平表型耐药株中，芯片检测出119株rpoB位点突变；表型敏感株中，检测出9株rpoB位点突变，与表型药敏株结果比较，敏感度为94．40％；特异性为86．76％。118株异烟肼表型耐药株中，芯片检测共109株出现耐药基因位点突变，其敏感度为92．37％；特异性为81．16％。44株乙胺丁醇表型耐药株中，27株在embB306位点上突变；表型敏感株中，有6株检测到embB306位点突变，其敏感度为61，36％；特异性为95．80％。102株喹诺酮类药物表型耐药株中，81株gyrA基因突变；敏感株中有4株检测到gyrA突变，敏感度为79．41％；特异性为95．29％。112株链霉素表型耐药株中，芯片检测出101株突变，其敏感度为90．17％；特异性为84．00％。二线抗结核药物（阿米卡星、卷曲霉素、卡那霉素）具有交叉耐药性，在67株表型耐药株中，52株存在突变；在表型敏感株中，有11株rrs1401突变，敏感度为77．61％，特异性为87．50％。结论通过Tag Array结核耐药基因检测芯片可实现结核耐药快速、准确、高通量检测，具有重要的临床意义及可行性。

主 题 词：广泛耐药结核 基因检测 敏感性与特异性 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 1010[医学-医学技术类] 100201[100201] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3760/cma.j.issn.0253-2352.2018.02.007

馆 藏 号：203283264...