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微滴式数字PCR中低浓度荧光微滴分类

微滴式数字PCR中低浓度荧光微滴分类

作     者:刘聪 董文飞 张涛 周武平 蒋克明 黎海文 LIU Cong;DONG Wen-fei;ZHANG Tao;ZHOU Wu-ping;JIANG Ke-ming;LI Hai-wen

作者机构:中国科学院苏州生物医学工程技术研究所江苏苏州215163 中国科学院大学北京100039 

基  金:中国科学院科研装备研制资助项目(No.YZ201444) 苏州市科技发展计划资助项目(No.SYG201503) 

出 版 物:《光学精密工程》 (Optics and Precision Engineering)

年 卷 期:2018年第26卷第3期

页      码:647-653页

摘      要:数字PCR检测过程中,确定微滴是否为阳性直接影响最终浓度,也是影响仪器准确度的重要因素之一。目前的自动分类方法并未考虑到数字PCR技术中浓度对结果误差的影响,导致在低浓度下自动设置的方法与实际结果偏差较大。本文设计了一种基于广义帕累托分布的荧光微滴分类方法,讨论了不同浓度下误分类对结果可能的影响,据此确定了分布模型参数,并在自行研制的微滴式数字PCR仪上进行验证。实验结果显示:经本文方法分类后,样品中目标拷贝数在5~5 000的范围内线性回归的r_2=0.995 6,这意味着广义帕累托分布较好地拟合了微滴荧光强度边界分布,本文提出的荧光微滴自动分类方法在低浓度下取得了较好的效果。

主 题 词:数字PCR 广义帕累托分布 荧光微滴分类 

学科分类:0810[工学-土木类] 08[工学] 080401[080401] 0804[工学-材料学] 080402[080402] 0835[0835] 081002[081002] 

核心收录:

D O I:10.3788/OPE.20182603.0647

馆 藏 号:203284636...

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