磁珠富集法开发蕨麻SSR标记引物

作     者：富贵 李军乔 包锦渊 白世俊 韦梅琴 FU Gui;LI Jun-qiao;BAO Jin-yuan;BAI Shi-jun;WEI Mei-qin

作者机构：青海民族大学青藏高原蕨麻研究中心青海西宁810007 "青海省高原作物种质资源创新与利用"国家重点实验室培育基地青海西宁810016 青海省生物技术与分析测试重点实验室青海西宁810007 青海大学农牧学院青海西宁810016 

基　　金："青海省高原作物种质资源创新与利用"国家重点实验室培育基地开放课题(2014-10) 科技部农业科技成果转化基金项目(2010GB2G00514) 国家自然科学基金项目(31660425 30607026 30660019) 青海省自然科学基金项目(2012-Z-907)资助 

出 版 物：《草业学报》 (Acta Prataculturae Sinica)

年 卷 期：2018年第27卷第2期

页      码：124-134页

摘      要：微卫星序列(SSR)因具有分布广、共显性遗传、稳定、多态性丰富等优点而被广泛应用于动植物遗传研究中。利用EcoRⅠ,MseⅠ2种内切酶酶切蕨麻基因组,酶切片段与用生物素标记的探针(AG)15、(GT)15杂交,然后通过链霉亲和素磁珠富集、含有SSR片段的基因组片段被吸附,再经洗脱、PCR扩增、克隆和测序,完成微卫星序列的收集。共获得有效克隆236个,随机挑选其中80个进行测序,结果显示68条序列(85%)为唯一序列,挑选出其中40条含有SSR位点的序列,用引物设计软件Primer 5成功设计出40对引物,经初步筛选,最终获得多态性丰富,可稳定扩增的SSR引物20对,扩增成功率达50%。对20对引物扩增结果做了初步分析,扩增出多态性位点共338个,平均每对引物扩增出17个,平均有效等位基因数(Ne)、多态性信息含量(PIC)、Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon’s信息指数(I)平均值分别为1.2440、0.8996、0.1768和0.3078。20对SSR引物为蕨麻遗传变异研究提供了新的分子标记工具。

主 题 词：蕨麻 微卫星 磁珠富集 分子标记 

学科分类：09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

核心收录：

D　O　I：10.11686/cyxb2017144

馆 藏 号：203284701...