诱导耐药沙门菌CRISPR检测及cas基因表达分析

作     者：王磊 赵霞 王文静 张瑞良 代兴杨 曾明华 李琳 WANG Lei, ZHAO Xia, WANG Wenjing, ZHANG Ruiliang, DAI Xingyang, ZENG Minghua, LI Lin

作者机构：安徽农业大学动物科技学院安徽合肥230036 

基　　金：国家自然科学基金项目(31772802) 安徽高校自然科学重点研究项目(KJ2017A132) 安徽省优秀青年人才支持计划重点项目(gxyq ZD2016041) 

出 版 物：《南京农业大学学报》 (Journal of Nanjing Agricultural University)

年 卷 期：2018年第41卷第2期

页      码：370-376页

摘      要：[目的]通过对诱导耐药沙门菌成簇间隔的短回文重复序列(CRISPR)比对分析,以及cas(CRISPR associated)mRNA表达水平的变化,探讨CRISPR/Cas与沙门菌耐药性的关系。[方法]对鼠伤寒沙门菌ATCC13311进行耐药诱导分别获得3株体外诱导耐药(环丙沙星、庆大霉素、氨苄西林)菌和1株体内诱导耐药(环丙沙星)菌,设计引物对CRISPR,进行PCR扩增并检测,应用CRISPR Finder分析CRISPR序列,对5株沙门菌的CRISPR序列进行比对;利用RT-q PCR检测耐药前后沙门菌cas1、cas6、casA mRNA表达水平的变化。[结果]成功扩增出2段CRISPR序列(CRISPR1、CRISPR2),耐药菌碱基的突变均发生在前导区和序列末端;CRISPR1序列的突变发生在前导区的1~4 bp和序列末端的1 136~1 144 bp区域内;CRISPR2序列的突变发生在前导区的1~14 bp和序列末端的780~796 bp区域内;重复间隔序列保守且发现有重复序列的退化现象(degeneration repeats,DRs),同时耐药菌cas1、cas6、casA mRNA的表达水平下降。[结论]提示:沙门菌CRISPR序列突变和cas mRNA表达水平下降与其耐药性有关。

主 题 词：沙门菌 诱导耐药 成簇间隔短回文重复序列 cas mRNA表达量 

学科分类：090603[090603] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录：

D　O　I：10.7685/jnau.201701021

馆 藏 号：203284714...