羊IL-1Ra基因全长cDNA克隆及生物信息学分析

作     者：水一鸣 刘楠楠 郭兴 邹德颖 翟菲菲 王路鹿 鞠丹迪 张士军 胡盼 李岩松 卢士英 周玉 柳增善 李兆辉 任洪林 SHUI Yiming1 , LIU Nannan1 , GUO Xing2 , ZOU Deying2 , ZHAI Feifei1, WANG Lulu1 , JU Dandi1 , ZHANG Shijun1, HU Pan1 , LI Yansong1 , LU Shiying, ZHOU Yu1 , LIU Zengshan1, LI Zhaohui1 , REN Honglin1

作者机构：吉林大学动物医学学院吉林大学人兽共患病研究所人兽共患病研究教育部重点实验室长春130062 盘锦检验检测中心盘锦124010 

基　　金：吉林省科技发展计划(20150204078NY 20170101149JC) 

出 版 物：《中国畜牧兽医》 (China Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期：2018年第45卷第3期

页      码：598-603页

摘      要：试验旨在对羊白介素1受体颉颃因子(interleukin-1receptor antagonist,IL-1Ra)基因进行全长cDNA克隆及生物学分析。根据布鲁氏菌感染羊白细胞层SSH cDNA文库中的IL-1Ra基因序列信息及已知核苷酸序列(GenBank登录号:KC425613.1)设计引物,利用RT-PCR结合RACE方法扩增并克隆IL-1Ra基因,对其进行序列及相关分子特性分析。结果表明,羊IL-1Ra基因全长为1 228bp,可编码174个氨基酸,含有1个完整的IL-1保守结构域和1个IL-1Ra结构域(PHA02651结构域)。IL-1Ra分子质量为19 765.8u,等电点(pI)为5.72,其分子式为C_(88)5H_(1385)N_(235)O_(256)S_(11),且含有信号肽。二级结构分析显示,IL-1Ra分子存在较多的β折叠及受体结合位点,与三级结构预测结果一致,且与人/鼠IL-1Ra分子的空间结构相似度极高,达到90%以上。羊IL-1Ra有IL-1特有的三叶草结构,其酶结合结构域位于TYR^(47)至GLU^(66)之间。将羊IL-1Ra与牛、虎鲸、宽吻海豚、猪、家犬、人、鼠等14个物种进行蛋白质同源性比对,发现在各物种间存在5个高度同源的半胱氨酸位点。系统进化树分析发现,羊IL-1Ra基因全长cDNA所编码的氨基酸序列同山羊、牛单独形成一个分支。本研究结果为今后深入研究IL-1Ra基因的生物学功能奠定了基础。

主 题 词：羊 IL-1Ra基因 生物信息学 分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.16431/j.cnki.1671-7236.2018.03.005

馆 藏 号：203284731...