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小麦Wcor15基因上游调控区克隆及生物信息学分析

小麦Wcor15基因上游调控区克隆及生物信息学分析

作     者:刘方方 殷桂香 佘茂云 Liu Fangfang;Yin Guixiang;She Maoyun

作者机构:安徽省农业科学院作物研究所合肥230031 

基  金:安徽省农业科学院院长青年创新基金项目(17B0203) 安徽省农业科学院科技创新团队项目(13C0202) 安徽省农业科学院院长青年创新基金项目(16B0204)共同资助 

出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期:2018年第16卷第4期

页      码:1033-1039页

摘      要:为了克隆小麦Wcor15基因启动子序列和预测可能的表达调控途径,试验设计特异引物采用PCR方法从小麦基因组DNA中直接进行扩增并测序,用Neural Network Promoter Prediction、Promoter SCAN、Promoter 2.0和Meth Primer软件对启动子结构进行分析,PLACE在线分析预测可能的顺式作用元件。结果表明:克隆获得了一段长度为2 046 bp的Wcor15基因上游调控区序列,软件预测显示该区域含有4个可能的启动子,除了具有一般启动子的CAAT-box、TATA-box典型结构外,还含有CBFHV、ACGTATERD1、ABRELATERD1、ARR1AT、CANBNNAPA应答非生物胁迫、激素等重要作用元件。序列比对发现小麦Wcor15启动子与拟南芥cor15a、大麦cor14b的一致性分别为36.92%和40.29%。

主 题 词:小麦 Wcor15基因 启动子 克隆 生物信息学 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.13271/j.mpb.016.001033

馆 藏 号:203284868...

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