滇西南地区埃及伊蚊种群微卫星标记筛选研究

作     者：刘蓬勃 孙琬琬 王君 刘起勇 宋秀平 郭玉红 鲁亮 LIU Peng-bo;SUN Wan-wan;WANG Jun;LIU Qi-yong;SONG Xiu-ping;GUO Yu-hong;LU Liang

作者机构：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 

基　　金：国家重点研发计划(2016YFC1200503 2016YFC1200802) 

出 版 物：《中国媒介生物学及控制杂志》 (Chinese Journal of Vector Biology and Control)

年 卷 期：2018年第29卷第2期

页      码：130-133页

摘      要：目的研究滇西南地区埃及伊蚊种群遗传学特征,针对该地区的埃及伊蚊种群筛选新的微卫星位点。方法从美国国立生物技术信息中心Gen Bank数据库中下载埃及伊蚊全基因组数据,利用Tandem Repeats Finder软件查找全基因组中的微卫星位点,选择重复单位为2~4 bp且重复次数<30的微卫星位点,对其侧链进行BLAST比对,选择在基因组中单拷贝的位点设计引物,再对引物进行BLAST比对,选择扩增产物为单拷贝的引物进行相关筛选。结果从17个全基因组中共获得80条微卫星序列,并成功设计出11对多态性引物,核心序列包括5对2碱基重复,5对3碱基重复以及1对4碱基重复,共有98个等位基因,平均每对引物有9个等位基因,观察杂合度平均值为(0.394±0.026)。结论设计引物可稳定地扩增出目标条带,且多态性较高,可以用于埃及伊蚊的种群遗传学研究。

主 题 词：埃及伊蚊 微卫星 引物 

学科分类：1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

D　O　I：10.11853/j.issn.1003.8280.2018.02.004

馆 藏 号：203286367...