海洋弧菌(Vibrio sp. QD-5)褐藻胶裂解酶基因的克隆和生物信息学分析

作     者：晁雅熙 王淑艳 吴谡琦 陈颢 CHAO Ya-xi;Wang Shu-yan;WU Su-qi;CHEN Hao

作者机构：国家海洋局第一海洋研究所山东青岛266061 

基　　金：国家重点基础研究计划--超深渊生物群落及其与关键环境要素的相互作用机制研究(2015CB755906) 海洋公益性行业科研专业--基于海洋微生物发酵的新产品开发技术研究与应用(201505032) 

出 版 物：《海洋科学进展》 (Advances in Marine Science)

年 卷 期：2018年第36卷第2期

页      码：290-300页

摘      要：以海洋弧菌(Vibrio ***-5)的基因组为模板,使用设计的褐藻胶裂解酶引物进行PCR扩增。将目的基因克隆至pet-22b(+)载体后进行测序。测序结果显示,基因aly-Ⅱ的大小为2 170bp,预测编码含有723个氨基酸的蛋白质。对该蛋白质进一步进行了生物信息学分析。利用ProtParam和ProtScale对蛋白质的理化性质进行分析,结果表明,蛋白质Aly-Ⅱ的理论分子质量为85.6kDa,理论等电点为5.1,并且是一种亲水性蛋白。利用软件MEG 6.0对蛋白质Aly-Ⅱ进行系统发育分析,结果显示,蛋白质Aly-Ⅱ很可能是PL-17家族的褐藻胶裂解酶。利用同源建模法构建蛋白质Aly-Ⅱ的三维结构,Aly-Ⅱ含有2个结构域,分别为(α/α)6toroid结构域和β-sheet结构域。

主 题 词：Vibrio sp. 褐藻胶裂解酶 基因克隆 生物信息学分析 

学科分类：08[工学] 082203[082203] 0822[工学-核工程类] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1671-6647.2018.02.014

馆 藏 号：203289033...