柿SCoT-PCR体系优化及品种遗传多样性分析

作     者：夏乐晗 杨婷婷 杨勇 夏宏义 张永芳 王仁梓 XIA Lehan;YANG Tingting;YANG Yong;XIA Hongyi;ZHANG Yongfang;WANG Renzi

作者机构：西北农林科技大学园艺学院陕西杨陵712100 

基　　金：国家公益性行业(农业)科研专项(201203047) 农业部农作物种质资源保护项目(NB2012-2130135-21) 

出 版 物：《西北植物学报》 (Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica)

年 卷 期：2014年第34卷第3期

页      码：473-480页

摘      要：选用国家柿种质资源圃中24个牛心柿和22个野柿为实验材料，采用L16（4^5）正交试验设计，建立了最优SCoT-PCR反应体系（20μL反应体系中，含Mg^2＋ 2．0mmol／L，dNTPs0．2mmol／L，Taq聚合酶l.0U，引物0．5μmol／L，DNA模板80ng），并对不同引物的退火温度进行了优化，以探讨SCoT标记在柿亲缘关系鉴定和品种分类方面的应用。结果显示：（1）10条SCoT引物对46份材料共扩增出176个位点，其中多态性位点170个，多态率达96．6％；46份材料的遗传相似系数在0．619～O．852之间。（2）UPGMA聚类分析显示，SCoT标记能将46份材料完全区分开，其中：红花雄野毛柿、红花雌野毛柿单独被聚为一组，独立于牛心柿和野柿之外，与形态特征观察结果一致；璧山牛心柿与野柿聚为一组，在形态特征上璧山牛心柿也更趋于野柿，且璧山牛心柿为四倍体，与其他牛心柿（六倍体）不同，璧山牛心柿应属于野生柿。研究表明，SCoT标记是研究柿种质资源遗传多样性的有效手段；46份材料存在着较高的遗传多样性，在一定程度上反映了品种的地理分布情况，也说明地理因素对柿的亲缘关系有很大影响。

主 题 词：SCoT标记 柿 体系优化 遗传多样性 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.7606/j.issn.1000-4025.2014.03.0473

馆 藏 号：203289047...