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梨S基因检测芯片的oligo探针设计

梨S基因检测芯片的oligo探针设计

作     者:江南 谭晓风 JIANG Nan;TAN Xiao-feng

作者机构:湖南工业大学绿色包装与生物纳米技术应用湖南省重点实验室湖南株洲412008 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 

基  金:国家自然科学基金面上项目(31272124) 湖南省自然科学基金项目(12JJ6017) 

出 版 物:《经济林研究》 (Non-wood Forest Research)

年 卷 期:2012年第30卷第3期

页      码:1-5,36页

摘      要:为给梨品种S基因芯片的制备及梨品种自交不亲和性S-RNase基因和S基因型的检测奠定基础,结合已有的对梨自交不亲和S-RNase基因的研究成果及Genbank中梨S-RNase基因信息,利用生物学比对软件Genedoce对梨S-RNase等位基因序列进行比对,得到等位基因HV区的特异序列;用oligo6.71、Premier Premier 5.0和Clustal.W等生物学软件设计特异性高、解链温度Tm值接近、长度均一的oligo探针,获得了24条32 mer的oligo探针。

主 题 词: 自交不亲和性 S-RNase oligo探针 

学科分类:09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

D O I:10.14067/j.cnki.1003-8981.2012.03.010

馆 藏 号:203294817...

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