残基突变对P53-DNA结合域肽段构象影响的分子动力学模拟

作     者：许朝莹 赵立岭 曹赞霞 王吉华 XU Zhao-Ying;ZHAO Li-Ling;CAO Zan-Xia;WANG Ji-Hua

作者机构：山东省功能大分子生物物理重点实验室(德州学院)山东德州253023 山东师范大学物理与电子科学学院济南250014 德州学院物理系山东德州253023 

基　　金：国家自然科学基金(30970561 31000324) 山东省自然科学基金(2009ZRA14027 2009ZRA14028)资助项目~~ 

出 版 物：《物理化学学报》 (Acta Physico-Chimica Sinica)

年 卷 期：2012年第28卷第7期

页      码：1665-1675页

摘      要：基于分子动力学模拟方法研究了R249S、R248W和G245S突变对P53-DNA结合域肽段(残基230-258)结构的影响.采用GROMACS软件包和GROMOS43A1分子力场,分别对野生型wtP53肽段、单点突变型P53-R249S肽段、两点突变型P53-R249S/R248W肽段和三点突变型P53-R249S/R248W/G245S肽段进行了4组独立的分子动力学模拟,每组体系模拟时间为500ns.研究结果表明:R249S单残基突变影响肽段残基形成二级结构的情况,但不改变肽段三维结构的模式,同时使该肽段结构相对稳定;R249S和R248W两残基同时突变会加剧R249S突变对肽段的影响,同时导致三维结构发生较大变化,构象弯曲呈现双turn结构,肽段稳定性进一步增大;G245S突变对肽段的影响与R249S和R248W同时突变对其结构的影响相反,在两残基突变的基础上,G245S突变会使原突变引起的变化减弱甚至消失,同时使得该肽段结构稳定性减小.该研究对认识肿瘤致病分子机制和设计新药物有重要意义.

主 题 词：P53蛋白 残基突变 结构变化 分子动力学模拟 结构异质性 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 0703[理学-化学类] 0702[理学-物理学类] 

核心收录：

D　O　I：10.3866/pku.whxb201204182

馆 藏 号：203295959...