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Schr?dinger药物虚拟筛选流程模块在大学生物和化学信息学教学中的应用

Schr?dinger药物虚拟筛选流程模块在大学生物和化学信息学教学中的应用

作     者:白启峰 张洋 靳玲玲 姚小军 BAI Qifeng1, ZHANG Yang3, JIN Lingling1, YAO Xiaojun2,4

作者机构:兰州大学基础医学院兰州730000 兰州大学网络安全与信息化办公室兰州730000 兰州大学化学化工学院兰州730000 澳门科技大学中药质量研究国家重点实验室澳门999078 

基  金:国家自然科学基金青年项目(21605066) 兰州大学中央高校基本科研业务费专项资金资助(lzujbky-2017-122) CERNET Innovation Project(NGII20160513) 

出 版 物:《大学化学》 (University Chemistry)

年 卷 期:2018年第33卷第5期

页      码:66-71页

摘      要:介绍了Schr?dinger药物虚拟筛选的基本原理和流程,结合大学生物和化学信息学课程的相关教学内容,分别描述了蛋白受体的预处理、类药性五原则、毒药物动力学(ADME)、泛筛选干扰化合物(PAINS)、高通量虚拟筛选、标准精度筛选、高精度筛选和MM/GBSA的打分排序原理和使用方法。该软件可以在大学生物和化学信息学的教学中演示,有助于提高学生对蛋白结构、分子构象、药物虚拟筛选和计算机辅助分子设计的理解,该软件有很好的图形界面,可以给学生直观的体验,大大丰富了大学课堂的教学内容。此外,该软件在药物设计领域里面也有很好的应用价值,大大节约了药物筛选的成本,提高了药物发现的效率。

主 题 词:Schr dinger Glide 虚拟筛选 分子对接 

学科分类:040106[040106] 0401[教育学-教育学类] 04[教育学] 07[理学] 0703[理学-化学类] 

D O I:10.3866/PKU.DXHX201801023

馆 藏 号:203296140...

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