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山东省2012年~2016年猪流行性腹泻病毒分子流行病学调查及对其ORF3基因分析

山东省2012年~2016年猪流行性腹泻病毒分子流行病学调查及对其ORF3基因分析

作     者:张月 李玉杰 马慧玲 王贵升 蔺晓月 孙圣福 孔祥华 王苗利 陈静 田夫林 ZHANG Yue;LI Yu-jie;MA Hui-ling;WANG Gui-sheng;LIN Xiao-yue;SUN Sheng-fu;KONG Xiang-hua;WANG Miao-li;CHEN Jing;TIAN Fu-lin

作者机构:山东省动物疫病预防与控制中心山东济南250022 

基  金:山东省自然基金-猪流行性腹泻病毒流行病学调查及口服疫苗的研究(ZR2017BC104) 

出 版 物:《中国预防兽医学报》 (Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine)

年 卷 期:2018年第40卷第5期

页      码:447-450页

摘      要:为了解山东省猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行情况,本研究采用RT-PCR的方法对2012年1月~2016年12月山东省13个地市采集的258份疑似PEDV感染样品进行检测,并设计引物扩增PEDV ORF3基因片段,通过生物信息学软件对26个具有代表性的完整的PEDV ORF3基因序列进行遗传进化分析。结果显示PEDV平均每年检出率达72.1%,表明PEDV是当前山东地区仔猪腹泻的主要致病病原。遗传进化分析显示,26株PEDV ORF3基因序列属于G2基因型,与其它参考PEDV病毒株同源性较高(93.8%~100%),相对保守。其中3株PEDV流行株位于2a亚型中,这在华北地区属首次报道。PEDV 2a亚型基因序列具有特异位点突变,可作为鉴别2a亚型与其它亚型的分子标记。本研究揭示了山东省PEDV流行株ORF3基因的主要基因型,为该省PEDV的防控提供依据。

主 题 词:猪流行性腹泻病毒 ORF3基因 突变 2a亚型 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1008-0589.201708012

馆 藏 号:203296196...

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