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蓖麻RcFAH12基因cDNA全长克隆及生物信息学分析

蓖麻RcFAH12基因cDNA全长克隆及生物信息学分析

作     者:狄建军 张庆波 王月 佘集凯 张树军 黄凤兰 李国瑞 陈永胜 陈宇杰 Di Jianjun;Zhang Qingbo;Wang Yue;She Jikai;Zhang Shujun;Huang Fenglan;Li Guorui;Chen Yongsheng;Chen Yujie

作者机构:内蒙古民族大学生命科学学院通辽028043 沈阳农业大学农学院沈阳110866 内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心通辽028043 内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室通辽028043 内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心通辽028043 内蒙古民族大学生物信息学重点实验室通辽028043 内蒙古民族大学农学院通辽028043 

基  金:国家青年科学基金项目(31401418) 国家自然科学基金项目(31160290 31460353) 内蒙古自治区自然科学基金面上项目(2017MS0339) 内蒙古自治区科技创新引导奖励资金项目(KJCX15002) 内蒙古自治区"草原英才"计划项目(201511) 内蒙古自治区草原英才创新团队支持项目(2017) 内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心开放基金项目(MDK2017031 MDK2017030 MDK2016008) 内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室开放基金项目(MDK2016030 MDK2016031 MDK2017034 MDK2017035)共同资助 

出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期:2018年第16卷第14期

页      码:4583-4591页

摘      要:RACE技术是一项扩增基因末端序列的新技术。本研究以蓖麻籽的RNA为模板,以Gen Bank上FAH12基因序列设计特异引物,运用RT-PCR和RACE技术扩增并获得了特异片段。该片段经PCR、酶切和测序验证,证实所克隆序列为蓖麻FAH12的cDNA全长序列。生物信息学分析,此片段包含1 164 bp组成的开放读码框(ORF),编码387个氨基酸,分子量为44 426.21 Da,p I=8.95。同源性分析结果表明,它与麻疯树、陆地棉、百脉根和杏的FAH12基因的同源性均高于70%。构建了系统进化树,蓖麻和麻风树、橡胶、木薯聚类到一起,这与生物学分类相同,都为大戟科植物。成功克隆蓖麻FAH12基因c DNA全长,这为后续进一步的分子生物学研究提供了帮助。

主 题 词:蓖麻 FAH12基因 RT-PCR RACE 克隆 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.13271/j.mpb.016.004583

馆 藏 号:203304893...

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