伤寒沙门菌非编码RNA AsfD的分子鉴定及表达特性

作     者：刘锐 种晓丹 赵昕 陆仁飞 孙嘉遥 黄新祥 LIU Rui;ZHONG Xiao-dan;ZHAO Xin;LU Ren-fei;SUN Jia-yao;HUANG Xin-xiang

作者机构：江苏大学医学院江苏镇江212013 海军军医大学转化医学研究院肿瘤研究所上海200433 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(31670131) 

出 版 物：《江苏大学学报（医学版）》 (Journal of Jiangsu University：Medicine Edition)

年 卷 期：2018年第28卷第3期

页      码：232-236页

摘      要：目的:对伤寒沙门菌flhDC基因对侧编码的疑似非编码RNA AsfD进行分子鉴定及表达特性分析。方法:在AsfD已知序列区设计特异性引物,体外转录制备RNA探针,通过RNA印迹检测伤寒沙门菌AsfD的表达;使用cDNA末端快速扩增(5 rapid amplification of cDNA ends,RACE)和RT-PCR分析AsfD的转录起始位点和终止区域;用qRT-PCR检测AsfD在伤寒沙门菌不同生长时相和环境应激下的表达特性。结果:RNA印迹结果表明,伤寒沙门菌中确实存在AsfD表达,长度在2 300 nt左右;5 RACE分析表明,AsfD转录起始点位于flhC基因终止密码子下游590 bp;RT-PCR结果表明其转录终止区域位于flhD基因起始密码子上游558～788 bp之间;序列分析显示AsfD全区域没有明显的ORF结构;qRT-PCR结果显示,AsfD在伤寒沙门菌生长的稳态期表达较高,酸、氧和高渗环境应激后均明显下降(P<0.01)。结论:AsfD为伤寒沙门菌一长链非编码RNA,在不同时相和应激条件下存在表达调节。

主 题 词：伤寒沙门菌 非编码RNA AsfD 环境应激 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

D　O　I：10.13312/j.issn.1671-7783.y180054

馆 藏 号：203305008...