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贵州省PEDV与PoRV分子流行病学调查

贵州省PEDV与PoRV分子流行病学调查

作     者:丁尊俄 冯旭芳 张双翔 何贤海 胡兴义 张海 王开功 文明 程振涛 李晨 蒲翠敏 罗引幸 刘丽娟 周碧君 Ding Zun'e;Feng Xufang;Zhang Shuangxiang;He Xianhai;Wang Kaigong;Wen Ming;Cheng Zhentao;Li Chen;Pu Cuimin;Luo Yinxing;Liu Lijuan;Zhou Bijun

作者机构:贵州大学动物科学学院贵阳550025 贵州省动物疫病研究室贵阳550025 贵州省德江县动物疫病预防控制中心德江565200 贵州省动物疫病预防控制中心贵阳550001 

基  金:“贵州省科学技术厅农业公关项目”项目(黔科合NY3009-1号) “贵州省动物疫病防控与兽医公共卫生保障科技创新人才团队”(黔科合人才团队4016号)共同资助 

出 版 物:《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期:2018年第37卷第6期

页      码:2397-2402页

摘      要:为探明贵州省近几年引起猪病毒性腹泻两个主要病原PEDV与PoRV的变异情况,本研究对贵州省贵阳市、遵义市、安顺市、黔东南洲等5个地(州市)26个规模化养猪场采集了213份疑似腹泻的粪便样品,采用实验室建立的PEDV、TGEV和PoRV三重RT-PCR检出PEDV阳性的病料12份和PoRV阳性病料4份。根据GenBank登录的PEDV和PoRV基因序列,分别设计PEDV M基因和PoRV VP7基因特异性引物,扩增目的基因、克隆、测序和遗传进化分析。结果显示:成功克隆了12株PEDV M基因(681 bp)和4株PoRV的VP7基因(981 bp),M基因核苷酸及推导的氨基酸同源性分别在98.1%~100%和98.2%~100%之间,与国内外参考毒株核苷酸及氨基酸同源性分别在97.4%~100%和97.3%~100%之间;VP7基因核苷酸及推导的氨基酸同源性分别为95.5%~99.7%和96.9%~99.7%,与国内外参考毒株核苷酸及氨基酸同源性分别为71.9%~95.1%和72.7%~99.1%。贵州省PEDV地方流行株与疫苗株CV777、Attenuated DR13亲缘关系较远,PoRV地方流行株与G4型毒株Gottfried、HeN4等属于同一群。结果表明,本研究从分子流行病学角度证实了贵州省PEDV和PoRV流行与变异情况,为贵州省PEDV和PoRV合理的防控措施提供参考依据。

主 题 词:PEDV PoRV 基因序列 亲缘关系 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录:

D O I:10.13417/j.gab.037.002397

馆 藏 号:203305042...

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