胶州湾浮游桡足类18S核糖体RNA基因(18S rDNA)扩增及序列变异初步研究

作     者：门荣新 杨官品 刘永健 管晓菁 

作者机构：中国海洋大学海洋生命学院 

基　　金：国家自然科学基金资助项目 40176028号 

出 版 物：《海洋与湖沼》 (Oceanologia Et Limnologia Sinica)

年 卷 期：2005年第36卷第1期

页      码：88-96页

摘      要：采用PCR扩增、文库构建、限制性片段长度多态性分析、序列分析和系统学分析等方法,初步研究了夏季胶州湾上层海水浮游桡足类核糖体小亚基RNA基因(18SrDNA)约1.5kb片段的序列变异。从浮游生物混合DNA中选择性扩增桡足类18SrDNA,建立桡足类18SrDNA变异类型文库,并从文库中随机挑选的30个克隆进行分析。结果表明,VspI限制性内切酶能将这些克隆分成频率分别为0.17、0.23和0.6的3种操作分类单元(OTUs),遗传多样性指数达到0.95。3条OTU代表克隆序列与甲壳纲桡足亚纲核苷酸差异数在75.4—97.8之间,而与其他亚纲的差异都高于100。3条OTU代表克隆序列均属于桡足亚纲,其中,AY437861和AY437862属于哲水蚤目。3条OTU代表克隆序列可分为2个高变异区和3个相对保守区,其GC%分别为47.37%、48.16%和48.57%。研究结果表明,混合DNA提取方法简单,设计的引物可选择性地扩增浮游桡足类18SrDNA,根据18SrDNA序列序列变异描述浮游桡足类多样性是可行的。研究结果也为在浮游桡足类分类中引入18SrDNA序列奠定了基础。

主 题 词：18S核糖体RNA基因 桡足类 序列变异 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 071004[071004] 

核心收录：

D　O　I：10.3321/j.issn:0029-814X.2005.01.013

馆 藏 号：203310100...