基于PCR技术的人脑基因可变剪接差异性研究

作     者：张晓宇 熊洁仪 梁洪雨 邵宁一 Philipp Khaitovich 杨洪一 ZHANG Xiao-yu;XIONG Jie-yi;LIANG Hong-yu;SHAO Ning-yi;Philipp Khaitovich;YANG Hong-yi

作者机构：东北林业大学生命科学学院黑龙江哈尔滨150040 中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所中国科学院计算生物学重点实验室上海200031 

基　　金：中国科学院重要方向项目(KSCX2-EW-R-02-02) 

出 版 物：《现代生物医学进展》 (Progress in Modern Biomedicine)

年 卷 期：2012年第12卷第6期

页      码：1013-1016页

摘      要：目的:对人脑的基因可变剪接位点差异性进行分析。方法:通过RNA-Seq得到的转录组数据,分析推测出在不同年龄的7对样本的大脑前额叶皮层(prefrontal cortex,PFC)表达的某些基因具有可变剪接位点的差异性;为验证此推测,设计7对引物,提取不同年龄样本的RNA,通过反转录合成cDNA,采用PCR技术扩增目的序列。结果:在已剪接和(或)未剪接产物预期片段处有明显的条带。结论:通过Quantity One软件分析后,确定在不同年龄间存在可变剪接差异。基于PCR技术的基因可变剪接分析对RNA-seq数据集的预测结果进行验证是一种有效新颖的PCR新应用。

主 题 词：可变剪接 聚合酶链式反应 mRNA前体 RNA-seq 大脑前额叶皮层 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.13241/j.cnki.pmb.2012.06.003

馆 藏 号：203311150...