基于N基因的小反刍兽疫病毒贵州流行株分子特征与分群研究

作     者：王军 杨源 张云丹 文明 周碧君 程振涛 岳筠 李涛 WANG Jun1,2 , YANG Yuan1,2 , ZHANG Yundan1,2 , WEN Ming1,2 , ZHOU Bijun1,2 , CHENG Zhentao1,2 , YUN Jun3 , LI Tao3.

作者机构：贵州大学动物科学学院贵阳550025 贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室贵阳550025 贵州省动物疫病预防控制中心贵阳550008 

基　　金：贵州省科技合作项目(黔科合LH字(2015)7674号) 贵州省研究生教育创新计划项目(GZZ2017002) 贵州省科技创新人才团队项目(黔科合人才团队(2015)4016号) 

出 版 物：《中国畜牧兽医》 (China Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期：2018年第45卷第8期

页      码：2057-2066页

摘      要：为探讨小反刍兽疫病毒(peste des petits ruminants virus,PPRV)贵州流行株N基因分子特征和分群,试验设计了1对特异性引物,应用RT-PCR技术对小反刍兽疫(peste des petits ruminants,PPR)临床样本进行N基因扩增,克隆至pMD19-T载体,对阳性重组质粒进行测序,应用DANStar软件对测序序列和参考序列进行核苷酸同源性、氨基酸同源性、变异位点及系统进化树分析。结果显示:PPRV贵州流行株N基因扩增长度为1 578bp,其相互间核苷酸、氨基酸同源性分别为99.6%~100.0%及99.2%~100.0%,与国内参考株N基因的核苷酸序列(97.7%~99.9%)及氨基酸序列(98.3%~100.0%)同源性较国外参考株(88.5%~97.7%和92.2%~98.5%)高;PPRV贵州流行株N基因编码的氨基酸同疫苗株Nigeria 75-1相比存在26个位点突变,但没有氨基酸的缺失或增加;基于N基因系统进化分析显示,PPRV贵州流行株同国内参考株处于同一个进化分支,但与国外参考株处于不同进化分支;其属于病毒进化的Ⅳ基因群,与国内参考株处于同一系统分群,但与疫苗株Nigeria 75-1(Ⅰ基因群)处于不同基因群。

主 题 词：小反刍兽疫病毒(PPRV) N基因 序列分析 基因分群 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D　O　I：10.16431/j.cnki.1671-7236.2018.08.003

馆 藏 号：203312071...