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斑节对虾亲环素A(cyclophilinA)基因的克隆及启动子序列分析

斑节对虾亲环素A(cyclophilinA)基因的克隆及启动子序列分析

作     者:王卫芳 邱丽华 黄建华 张殿昌 苏天风 杨其彬 江世贵 WANG Wei-fang;QIU Li-hua;HUANG Jian-hua;ZHANG Dian-chang;SU Tian-feng;YANG Qi-bin;JIANG Shi-gui

作者机构:中国水产科学研究院南海水产研究所广东广州510300 华南农业大学动物科学院广东广州510642 

基  金:国家863高技术研究发展计划项目(2006AA603120) 广东省自然科学基金资助项目(7003894) 

出 版 物:《中国水产科学》 (Journal of Fishery Sciences of China)

年 卷 期:2009年第16卷第3期

页      码:324-331页

摘      要:通过同源克隆和RACE技术获得斑节对虾(Penaeus monodon)亲环素A(cyclophilin A,CYPA)的cDNA序列。根据已克隆的cDNA序列设计引物,利用染色体步移技术(Genomic DNA walking)从斑节对虾卵巢组织中克隆了CYPA基因的启动子和基因组DNA序列。测序结果表明,斑节对虾亲环素A(PmCYPA)cDNA全长834bp,其中开放阅读框(open reading frame,ORF)为495bp,可编码164个氨基酸;5’非编码区为31bp,3’非编码区为308bp。从斑节对虾基因组文库中扩增的CYPA基因组DNA全长3181bp,其中包括启动子区域1173bp,1个内含子426bp,2个外显子序列:分别为101bp和399bp。在5’UTR上游区域有明显的启动子序列,包含一个GC盒和2个CAAT盒,同时还包含AP1、CRE等调控元件,符合真核生物典型的启动子特征。分析基因的结构表明所克隆的PmCYPA符合PPlase家族成员特征,属于此基因家族成员。

主 题 词:斑节对虾 cyclophilinA基因 克隆 启动子 序列分析 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 071002[071002] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:1005-8737.2009.03.003

馆 藏 号:203317714...

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