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植物乳杆菌P8亚油酸异构酶基因及其上游非编码区的克隆与分析

植物乳杆菌P8亚油酸异构酶基因及其上游非编码区的克隆与分析

作     者:张昕艳 赵国芬 包秋华 张和平 

作者机构:内蒙古农业大学生命科学学院内蒙古呼和浩特010018 内蒙古农业大学食品科学与工程学院内蒙古呼和浩特010018 

基  金:内蒙古自治区自然科学基金项目(20080404MS0409) 

出 版 物:《食品科学》 (Food Science)

年 卷 期:2011年第32卷第17期

页      码:297-302页

摘      要:依据GenBank中已公布的亚油酸异构酶基因,设计一对特异性引物,PCR扩增该基因后,克隆到T载体上并转化到Trans1-T1感受态细胞中。经菌落PCR鉴定和序列分析表明,亚油酸异构酶基因大小为1720bp。该基因与植物乳杆菌AS1.555(DQ227322)的同源性达到99%,与泡菜植物乳杆菌(DQ010331)的同源性达到89%。该基因序列在GenBank上注册,编号为HM569265,对其进行生物信息学分析发现,基因中含有一段低复杂性区域。分析乳酸杆菌(CP001617)基因组全序列,设计了亚油酸异构酶基因上游非编码区805bp片段的特异性引物,PCR扩增该片段后将其克隆到T载体上并转化到Trans1-T1感受态细胞中。经菌落PCR鉴定后,进行序列分析和生物信息学的初步分析,预测出该片段中有12个基序,以及6个转录调控元件。

主 题 词:植物乳杆菌 亚油酸异构酶 克隆 生物信息学 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.7506/spkx1002-6630-201117062

馆 藏 号:203326463...

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