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甘薯褪绿矮化病毒西非株系实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

甘薯褪绿矮化病毒西非株系实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

作     者:王丽 王振东 乔奇 秦艳红 张德胜 田雨婷 王爽 张立军 张振臣 

作者机构:沈阳农业大学农学院沈阳110161 南阳师范学院生命科学与技术学院南阳473061 河南省农业科学院植物保护研究所河南省农作物病虫害防治重点实验室农业部华北南部作物有害生物综合治理重点实验室郑州450002 

基  金:国家甘薯产业技术体系建设项目资助(CARS-11-B-07) 河南省农业科学院财政预算项目资助 

出 版 物:《植物病理学报》 (Acta Phytopathologica Sinica)

年 卷 期:2014年第44卷第5期

页      码:461-468页

摘      要:依据Gen Bank中登录的甘薯褪绿矮化病毒(Sweet potato chlorotic stunt virus,SPCSV)西非株系(WA)的核苷酸序列,分别设计两对特异性引物和一条Taq Man探针。以SPCSV-WA外壳蛋白(cp)基因的重组质粒为阳性标准质粒绘制标准曲线,通过优化反应体系和反应条件,建立了SPCSV-WA的实时荧光定量PCR检测方法。试验结果表明,该方法只能检测到目的病毒,标准曲线的斜率和相关系数分别为-3.239和1,扩增效率为103.568%。最低可检测到约3.31 copies/μL的阳性质粒,灵敏度比常规PCR高1 000倍。本研究建立的SPCSV实时荧光定量PCR方法可用于田间样品的检测,为SPCSV的早期预警和流行学研究提供了技术手段。

主 题 词:甘薯褪绿矮化病毒西非株系 荧光探针 实时荧光定量PCR 

学科分类:09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 

核心收录:

D O I:10.13926/j.cnki.apps.2014.05.003

馆 藏 号:203335613...

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