库尔勒香梨的EST-SSR标记开发及遗传多样性分析

作     者：杨明禄 陈世有 付彬 韩旭 金强 董红强 YANG Ming-lu;CHEN Shi-you;FU Bin;HAN Xu;JIN Qiang;DONG Hong-qiang

作者机构：新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室新疆阿拉尔843300 塔里木大学植物科学学院新疆阿拉尔843300 塔里木大学南疆农业有害生物综合治理重点实验室新疆阿拉尔843300 

基　　金：新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室开放课题(BRYB1205) 国家自然科学基金(31360440) 

出 版 物：《广东农业科学》 (Guangdong Agricultural Sciences)

年 卷 期：2015年第42卷第18期

页      码：127-131页

摘      要：利用已公开的梨EST序列（2 398条）开发SSR引物,分析梨EST序列中SSR分布及特征,针对库尔勒香梨进行引物筛选,并分析受香梨优斑螟为害程度差异较大香梨18株样本的遗传多样性。结果表明：EST序列中有1 813条无冗余序列,141条含162个SSR,占全部EST的7.78%,出现频率8.94%,平均分布距离为4.93 kb,但不同微卫星的重复类型间差异很大（9.51~79.87 kb）,二核苷酸重复最为常见,占SSR比例达到51.85%。从设计的123对引物中,选取41对SSR引物进行筛选,发现17对引物扩增效果和多态性较好,共检测出111条多态性条带,等位基因Na为5.53,有效等位基因数Ne为3.74,Nei’s基因多样性指数He为0.69,Shannon’s多样性指数I为1.40,受害较重的G组香梨个体主要集中在UPGMA聚类的0.78分支处。

主 题 词：库尔勒香梨 EST-SSR 遗传多样性 

学科分类：09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1004-874X.2015.18.023

馆 藏 号：203335998...