异养硝化菌Alcaligenes faecalis NR氨单加氧酶PCR扩增及生物信息学分析

作     者：黄源生 赵彬 程丹阳 安强 Yuansheng Huang;Bin Zhao;Danyang Cheng;Qiang An

作者机构：重庆大学城市建设与环境工程学院重庆 

出 版 物：《微生物前沿》 (Advances in Microbiology)

年 卷 期：2017年第6卷第2期

页      码：44-51页

摘      要：氨单加氧酶(AMO)是异养硝化过程中起催化作用的关键酶之一,其相应的基因为amo。本研究根据NCBI数据库中amo基因序列设计引物,成功扩增粪产碱杆菌Alcaligenes faecalis NR基因组DNA中amo基因序列,得到长度为1639bp的DNA序列。该段序列包含1个完整的开放阅读框(ORF),编码长度为346aa的多肽链。经过BLAST在线比对分析,该序列为AMO蛋白质序列。该蛋白序列分子量大小为36.7kDa,是碱性蛋白也是疏水性蛋白。此外,AMO也是跨膜蛋白,有12个跨膜区。采用串线法成功构建AMO三级结构模型,模型置信度为98.6%。模型显示AMO含有一个镍原子结合位点。拉氏图表明,AMO模型位于最佳区域的氨基酸残基所占比例为94.9%,这说明模型构象良好。上述研究可为深入了解异养硝化过程中的关键酶提供参考。

主 题 词：异养硝化 粪产碱杆菌 氨单加氧酶 三级结构 

学科分类：083001[083001] 0830[工学-生物工程类] 08[工学] 

D　O　I：10.12677/AMB.2017.62006

馆 藏 号：203338872...