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靛玉红类CDK1抑制剂的同源模建、分子对接及3D-QSAR研究

靛玉红类CDK1抑制剂的同源模建、分子对接及3D-QSAR研究

作     者:张青青 姚其正 张生平 毕乐明 周之光 张骥 ZHANG Qing-Qing;YAO Qi-Zheng;ZHANG Sheng-Ping;BI Le-Ming;ZHOU Zhi-Guang;ZHANG Ji

作者机构:中国药科大学药学院南京210009 中国药科大学物理化学教研室南京210009 

基  金:国家"重大新药创制"科技重大专项(2009ZX09103-149)资助 

出 版 物:《物理化学学报》 (Acta Physico-Chimica Sinica)

年 卷 期:2014年第30卷第2期

页      码:371-381页

摘      要:细胞周期蛋白依赖性激酶1的异常表达会导致G2期的停滞及多种肿瘤的发生,故CDK1近年来已成为一个理想的治疗靶点.本文以细胞分裂调控蛋白2的同源体为模板,同源模建了CDK1的结构,并与靛玉红类小分子抑制剂进行分子对接.分别运用三种叠合方法进行分子叠合,并在此基础上采用Sybyl 7.1中的比较分子场分析(CoMFA)模块及Discovery Studio 3.0中的三维定量构效关系(3D-QSAR)模块(以下简称为DS)分别建立了3D-QSAR模型.其中,将分子对接叠合与公共骨架叠合联合运用的叠合方法所得3D-QSAR模型的评价参数是最佳的(CoMFA:q2=0.681,r2=0.909,r2pred.=0.836;DS:q2=0.579,r2=0.971,r2pred.=0.795,其中q2为交叉验证系数,r2为非交叉验证系数).本文的研究结果在对靛玉红类小分子进行结构修饰设计出新的CDK1抑制剂方面,可提供重要的理论基础.

主 题 词:细胞周期蛋白依赖性激酶1 靛玉红 3D-QSAR 比较分子场分析 同源模建 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 

核心收录:

D O I:10.3866/pku.whxb201312192

馆 藏 号:203350559...

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