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应用寡核苷酸芯片筛选维甲酸诱导神经母细胞瘤细胞系SH-SY5Y分化成神经元过程中的差异表达基因

应用寡核苷酸芯片筛选维甲酸诱导神经母细胞瘤细胞系SH-SY5Y分化成神经元过程中的差异表达基因

作     者:郑国强 王晓文 吴燕 刘淑红 艾洪滨 范文红 范明 ZHENG Guo-qiang;WANG Xiao-wen;WU Yan;LIU Shu-hong;AI Hong-bin;FAN Wen-hong;FAN Ming

作者机构:军事医学科学院基础医学研究所北京100850 山东师范大学生命科学学院山东济南250014 

基  金:国家高技术研究发展计划项目(2002-BA711A01-03) 

出 版 物:《生物技术通讯》 (Letters in Biotechnology)

年 卷 期:2006年第17卷第6期

页      码:852-855页

摘      要:目的:应用寡核苷酸芯片筛选维甲酸(RA)诱导神经母细胞瘤细胞系SH-SY5Y分化成神经元过程中的差异表达基因。方法:从人胎脑及不同类型神经系统肿瘤组织中获取目的基因,查询相应基因mRNA序列,设计并合成探针,制备了含218种基因的神经功能相关的寡核苷酸芯片。应用RA诱导SH-SY5Y8d分化成成熟神经元,提取对照组和实验组每天的总RNA,通过逆转录荧光标记cDNA探针并与芯片杂交,洗片后扫描获取图像,数据分析获得差异表达基因,并通过RT-PCR进行验证。结果:发现13种基因表达上调,没有得到下调基因。RT-PCR验证结果基本与芯片结果一致。结论:SH-SY5Y经RA诱导分化成神经元存在一些差异表达的基因,寡核苷酸芯片技术可为研究SH-SY5Y诱导分化成神经元的分子作用机理提供技术平台。

主 题 词:寡核苷酸芯片 维甲酸 神经母细胞瘤 RT—PCR 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D O I:10.3969/j.issn.1009-0002.2006.06.003

馆 藏 号:203357325...

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