白菜EST-SSR信息分析与标记的建立

作     者：忻雅 崔海瑞 卢美贞 姚艳玲 金基强 林容杓 崔水莲 Xin Ya;Cui Hairui;Lu Meizhen;Yao Yanling;Jin Jiqiang;Lim Yongpyo;Choi Suryun

作者机构：浙江大学农业与生物技术学院原子核农业科学研究所 忠南大学园艺系 

基　　金：韩国科学技术厅资助项目(98-0402-0601-5) 

出 版 物：《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)

年 卷 期：2006年第33卷第3期

页      码：549-554页

摘      要：数量迅速增加的EST为开发新的SSR标记提供了宝贵的资源。本研究对4584条白菜EST进行了搜索,共检索出474个SSR,检出率为10·3%,包括40种重复基元。其中二核苷酸和三核苷酸重复单元的EST-SSR占主导地位,二者出现的频率基本相近,占总SSR的近83%;其它重复类型所占比例均不足5%。GA和GAA是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复类型的71·5%和37·5%。设计了15对EST-SSR引物,在合适的PCR反应体系下,以构建EST的白菜自交系A的DNA为模板,对设计的EST-SSR引物进行筛选,发现15对EST-SSR引物都能扩增出产物。进一步用这些可扩增的引物对28个白菜品种进行PCR扩增,发现7对引物显示多态性,占引物总数的46·7%。此结果表明,根据EST建立EST-SSR标记是一条简便而又有效的途径。

主 题 词：白菜 EST SSR信息 标记 

学科分类：09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090202[090202] 

核心收录：

D　O　I：10.3321/j.issn:0513-353X.2006.03.018

馆 藏 号：203358070...